O currículo do CIEJA está organizado em módulos. Cada módulo corresponde a dois anos da escola regular, ou seja, a 1ª e a 2ª séries correpondem ao primeiro módulo, a 3ª e 4ª séries correspondem ao segundo módulo, a 5ª e a 6ª séries correspondem ao terceiro módulo e a 7ª e 8ª séries correspondem ao quarto módulo.
Cada módulo pode ter início tanto em no começo do ano quanto ao meio do ano, depende da necessidade da comunidade e da capacidade de estrutura de cada Cieja.
